А 8 ноября 1620 г. в битве у Белой Горы чехи, оставленные союзниками, были наголову разбиты объединенными силами императорской армии и Католической лиги. В 1627 г. Похоронный сейм в Праге закрепил утрату Чехией национальной независимости.
В августе 1623 г. вслед за Чехией и Пфальц был оккупирован армиями Спинолы и Католической лиги. Владения Фридриха V, бежавшего в Голландию, были переданы Максимилиану Баварскому.
Победа Габсбургов заставила зашевелиться правительства других стран. В феврале 1624 г. английский парламент высказался за войну с Испанией. В нелегкой ситуации оказалась Франция. Испанские войска оккупировали находившуюся под протекторатом Франции область Вальтелину, которая могла послужить коридором между испанскими и австрийскими Габсбургами. В феврале 1623 г. был заключен союз между Францией, Савойей и Венецией. Подобный союз, но только между Англией, Голландией и Данией, был заключен в Гааге в 1624 г. А в марте 1625 г. в Париже были обвенчаны ставший к тому времени английским королем Карл I и французская принцесса Генриетта-Мария. Казалось, антигабсбургские силы поднимают голову.
Однако и второй период войны — датский (1625–1629) принес успех Габсбургам. Несмотря на все заключенные союзы, перед лицом Габсбургов оказались лишь датский король Кристиан IV и северогерманские князья, субсидируемые Англией, Голландией и Францией. Английское правительство глубоко увязло в приносившей одни неудачи войне с Испанией. Во Франции пришедший к власти кардинал Ришелье готовился к осаде гугенотской Ла-Рошели, намереваясь добиться единства и централизации страны.
Осада Ла-Рошели (1627–1628) превратилась из гражданского конфликта в англо-французскую войну, поскольку Англия решила оказать помощь гугенотам. Несмотря на эту поддержку, Ла-Рошель была взята французскими правительственными войсками. В 1630 г., заключив мир с Испанией, Англия вышла из Тридцатилетней войны.
Оставшись практически в одиночестве, Кристиан IV направил в 1626 г. свою армию в междуречье Эльбы и Везера. Император не располагал крупными военными силами и средствами. Положение спас Альбрехт Валленштейн, талантливый полководец и самый опытный военачальник эпохи Тридцатилетней войны. Он за короткий срок на свои средства создал 30-тысячную армию, которая к 1630 г. насчитывала 100 тысяч человек. Продвинувшаяся на север армия Валленштейна вместе с армией Католической лиги, которой командовал Тилли, нанесла ряд сокрушительных поражений Кристиану IV и войскам протестантских князей. Валленштейн стал хозяином в Северной Германии.
В 1629 г. в Любеке был заключен мир, по которому Дания ничего не утратила территориально, но обещала не вмешиваться в германские дела. А Валленштейн тем временем решил вступить в борьбу за господство над Балтикой. Успехи полководца вызвали ревность и зависть в габсбургском лагере. Под давлением Максимилиана Баварского и Католической лиги Фердинанд II согласился уволить его в отставку, а войско распустить.
Главным поражением протестантов во втором периоде войны стало принятие императором в 1629 г. Реституционного эдикта, который восстанавливал права католической церкви на все имущество, захваченное протестантами с 1552 г. Эдикт вызвал возмущение не только протестантов, но и некоторых католических князей, опасавшихся усиления центральной власти в Империи.
В ходе третьего, шведского, периода войны (1630–1635) был достигнут перевес в пользу антигабсбургских сил. Честолюбивый и смелый полководец, шведский король Густав II Адольф давно хотел выступить против Империи, мечтая захватить Померанское побережье Балтики.
Летом 1630 г. шведский король высадился в Померании и начал свое триумфальное шествие по Империи. Его армия была необычна для Германии, где воюющие стороны использовали наемные войска. Она состояла из лично свободных крестьян и была однородной по национальному признаку. Шведы пришли в Германию под лозунгами защиты свобод немецких протестантов и поначалу не грабили местное население, что вызывало радостное изумление и теплый прием.
Густав II Адольф.
В сентябре 1631 г. Густав II Адольф одержал блестящую победу над командующим Католической лигой Тилли под Лейпцигом. Весной 1632 г. под Аугсбургом, на реке Лехе, Густав II Адольф разбил войска императора. В мае 1632 г. шведы вступили в Мюнхен — столицу Баварии.
Напуганный Фердинанд II опять обратился к Валленштейну. 10 ноября 1632 г. в битве при Лютцене шведы одержали победу и заставили Валленштейна отойти в Чехию, но в сражении погиб Густав II Адольф. Его смерть способствовала падению установившейся в Германии шведской гегемонии. Протестантские князья стали склоняться к идее примирения с Габсбургами, если те откажутся от проведения Контрреформации в их владениях. Этим воспользовался Валленштейн. В 1633 г. он повел переговоры со Швецией, Францией и Саксонией. Заподозрив своего полководца в измене, Фердинанд II в начале 1634 г. отстранил его от командования. А в феврале в крепости Эгер Валленштейн был убит преданными императору офицерами.
5-6 сентября 1634 г. шведская армия, утратившая былую дисциплину, потерпела поражение от императорских войск при Нордлингене. А весной 1635 г. в Праге был заключен мир между Фердинандом II и Саксонией, по которому император отказывался от проведения Реституционного эдикта в Саксонии на 40 лет. К Пражскому миру на таких же условиях присоединились и другие протестантские князья. Общеполитическая ситуация снова стала благоприятна для Габсбургов, и поэтому Франция решила вступить в войну.
Четвертый и заключительный, франко-шведский, период войны (1635–1648) начался 19 мая г. объявлением со стороны Франции войны Испании. Возобновив союз со Швецией, Ришелье также заключил договоры с Савойей, Мантуей и Пармой.
1635 г. был самым тяжелым для антигабсбургской коалиции за весь четвертый период войны. Император объявил Франции войну, испано-имперские войска повели наступление на всех фронтах. На северо-востоке была взята важная крепость Корби и открыта дорога на Париж — с городских стен были видны огни бивуаков испанской армии. Кроме того, испанцы захватили часть французской территории в Пиренеях. Положение исправилось лишь в конце года, когда была отвоевана Корби и очищена от врага Пикардия, а шведы разбили имперские войска при Витстоке.
В начале 40-х гг. определился перевес французов и шведов. Осенью 1642 г. шведы разбили императора при Брейтенфельде, затем заняли Саксонию и проникли в Моравию. Французы овладели Эльзасом, вместе с голландцами одержали ряд побед над Испанией в Южных Нидерландах, а особенно в битве при Рокруа в 1643 г. Европейскую войну затянул конфликт между Швецией и Данией в 1643–1645 гг. Кардинал Мазарини, сменивший умершего Ришелье, но столь же ловкий и умный политик, добился прекращения этой войны. Швеция, снова обратившаяся к германским делам, весной 1646 г. разгромила императорские и баварские войска при Янкове в Южной Чехии и повела наступление в направлении и Праги, и Вены. Император Фердинанд III (1637–1657) понял, что война проиграна.