17 августа 1942 г. «Лембит» вышла из Кронштадта на позицию в устье Финского залива. Утром 4 сентября в районе Утё лодка обнаружила вражеский конвой (8 транспортов в охранении 4 сторожевых кораблей и нескольких катеров) и произвела двухторпедный залп по второму транспорту. Судно считалось потопленным. 13 сентября «Лембит» безрезультатно атаковала торпедами еще один конвой. 14 сентября у о-ва Утё был обнаружен конвой (5 транспортов, 3 сторожевых корабля, катер). С дистанции 7–8 кбт. подводная лодка произвела двухторпедный залп по двум транспортам (это была первая на Балтике торпедная атака одновременно двух целей). Судно «Финланд» (2302 брт) затонуло. Кроме того, по не вполне достоверным данным был потоплен еще один транспорт. Лодка подверглась преследованию. Сторожевой корабль забросал ее глубинными бомбами. На лодке взорвалась аккумуляторная батарея, и возник пожар. В трюм третьего отсека стала поступать вода. Благодаря исключительному мужеству и выдержке личного состава пожар был ликвидирован и поступление воды прекращено. 15 сентября в Финском заливе «Лембит» обстреляли и забросали глубинными бомбами два катера противника. От взрывов был поврежден гирокомпас. 19 сентября лодка подошла к Лавенсари, где ее встретили два катера МО, и 22 сентября под их эскортом возвратилась в базу.
1-5 октября 1944 г. «Лембит» совершила переход из Кронштадта в район о-ва Утё. 5 октября по шхерному фарватеру она направилась на позицию. Но уже на следующий день из-за нарушения дифферентовки вернулась в шхерный район и вновь вышла в море 7 октября. 11 октября подводная лодка выставила 20 мин на подходах к Колбергу (Колобжег). 12 октября она несколько раз пыталась атаковать немецкий крейсер «Нюрнберг», но неудачно. 13 октября ночью в районе банки Штольпе она обнаружила транспорт, но первая атака оказалась неудачной. Лодка начала преследование, в 2.25 вторично атаковала транспорт и потопила его двумя торпедами. По послевоенным данным, это был транспорт «Хильма Лау» (2414 брт). 15 октября сразу после полуночи южнее о-ва Эланд «Лембит» атаковала из надводного положения немецкий тральщик, но торпеды прошли под целью. В результате повторной атаки тральщик считался потопленным. На следующий день из-за нехватки топлива «Лембит» направилась в Хельсинки, куда прибыла 18 октября. 24–28 ноября «Лембит» совместно с еще двумя лодками под конвоем сторожевого корабля и трех катеров МО перешла из Кронштадта к о-ву Утё. 1 декабря она заняла позицию в районе м. Брюстерорт. Выявив характер движения судов противника, подводная лодка 3 декабря выставила десять банок по две мины в каждой. 11 декабря «Лембит» атаковала конвой в составе трех транспортов и пяти кораблей охранения. Предполагалось, что один транспорт потоплен. В тот же день было обнаружено поступление воды в прочный корпус, и подводная лодка направилась в базу. 14 декабря на подходе к о-ву Утё, следуя на глубине 20–30 м (глубина в этом месте была 60 м), «Лембит» в результате скользящего удара была выброшена на глубину 4 м. При всплытии были обнаружены большое пятно соляра и деревянные обломки. Так как «Лембит» при столкновении повреждений не получила, ее командир предполагал, что таранил подводную лодку противника. Предположительно была потоплена германская лодка «U-479». 15 декабря «Лембит» прибыла в Ханко.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 6 марта 1945 г. подводная лодка «Лембит» была награждена орденом Красного Знамени.
23 марта подводная лодка «Лембит» под проводкой финского ледокола «Сампо» вышла из Хельсинки в район о-ва Утё, откуда вечером 23 марта начала самостоятельный переход на позицию на западных подходах к Данцигской бухте. В самом начале похода обнаружилась сильная течь обоих дейдвудных подшипников, которую устранить не удалось. Несмотря на это командир принял решение в базу не возвращаться. 28 марта лодка заняла отведенный ей район. 30 марта севернее м. Розеве были выставлены 20 мин.
С 31 марта силы ПЛО противника вели усиленный поиск в районе позиции подводной лодки. Ей неоднократно приходилось уклоняться от встреч с дозорными кораблями. 10 апреля, из-за многочисленных неисправностей, командир решил возвращаться в базу. 13 апреля в районе о-ва Лилла-Ботшер лодка была встречена ледоколом «Або» и 14 апреля прибыла в Хельсинки.
Подводная лодка «Лембит» совершила 6 боевых походов (104 суток), выполнила 8 торпедных атак, в результате которых потоплены 1 судно и 1 корабля, кроме того повреждено 1 судно и, возможно, еще потоплено 1 судно и повреждено 1 судно. Таранным ударом, возможно, потоплен 1 корабль. Выполнила 5 минных постановок — 100 мин.
Предположительно, на выставленных «Лембитом» минах погибли 10 ноября 1941 г. транспорт «Ворлатен» (5800 т), 28 ноября 1941 г. финский ТЩ «Порккала», 1 декабря 1941 г. финский КТЩ «Паукку», 26 февраля 1942 г. паром «Штарке» (2459 брт), 23 ноября 1944 г. буксир «Пионер-5», 6 декабря 1944 транспорт «Эберхард» (750 брт), 4 января 1945 г. транспорт «Лютьехорн» (1953 брт), 25 апреля 1945 СКР «Vs-343» — всего 5 судов и 3 корабля.
«Лембит» в сухом доке Свеаборга, январь 1945 г.
В 1946 г. лодка была выведена из боевого состава и становиться учебной. С 1979 г. использовалась в качестве филиала музея КБФ в Таллине. В мае 1985 г. «Лембит» установлена в Таллине на вечную стоянку в качестве мемориальной подводной лодки.
Гвардейские и орденоносные соединения кораблей
Кроме отдельных кораблей, в годы Великой Отечественной войны орденами Красного Знамени награждались и гвардейского звания удостаивались военные флотилии, бригады и дивизионы кораблей и катеров.
Орденом Красного знамени были награждены:
Ладожская военная флотилия Днепровская военная флотилия, Каспийская военная флотилия, Дунайская военная флотилия; Бригада подводных лодок СФ, бригада подводных лодок КБФ, 1-я Бригада подводных лодок ЧФ, 2-я бригада торпедных катеров ЧФ, бригада торпедных катеров СФ, 1-я бригада торпедных катеров КБФ, Отдельная бригада речных кораблей КБФ, 1-я бригада траления КБФ, 1-я и 2-я бригады речных кораблей ДВФ, 1-я бригада речных кораблей ДуВФ, 1-я бригада траления ДуВФ, 2-я бригада речных кораблей ДуВФ, 1-я бригада торпедных катеров ТОФ, 1-я и 2-я бригады речных кораблей КАФ.
1-й, 4-й, 5-й и 6-й дивизионы малых охотников за подводными лодками ЧФ, 2-й и 4-й дивизионы катеров-тральщиков КБФ, 1-й дивизион базовых тральщиков КБФ, Дивизион сетевых заградителей КБФ, 4-й дивизион тральщиков КБФ, 5-й, 10-й дивизион сторожевых катеров КБФ, 1-й дивизион торпедных катеров ЧФ, 1-й дивизион канонерских лодок КБФ, Дивизион морских бронекатеров КБФ, 6-й дивизион тральщиков СФ, 3-й дивизион пограничных катеров ТОФ, 7-й отдельный дивизион тральщиков ТОФ, 2-й отряд бронекатеров ЛВФ.
Гвардейского звания были удостоены:
1-й и 2-й дивизионы бронекатеров ВВФ, 1-й дивизион торпедных катеров КБФ, 1-й дивизион сторожевых катеров КБФ, 1-й отдельный дивизион бронекатеров ДВФ, 2-й и 3-й дивизионы торпедных катеров ТОФ, 1-й отдельный дивизион бронекатеров КАФ, 1-й отряд бронекатеров КАФ, 1-й дивизион катеров-тральщиков КБФ и 2-й дивизион малых охотников за подводными лодками СФ стали гвардейскими Краснознаменными.
