Вторжение в Утрехт и Оверэйссел в 1527 году, вероятно, стало самой большой ошибкой Карела, поскольку в ответ он получил именно то, чего пытался избежать. Теперь Карел оказался под давлением как с севера, так и запада. Он так и не смог заполучить контроль над Оверэйсселом, где власть князя-епископа сильно ослабла, но города и дворянство предпочитали покориться императору, нежели Гелдерланду. Тем временем князьепископ, не видя перспектив восстановления своей власти, был вынужден передать свои княжеские права в Утрехте и Оверэйсселе Карлу[25]. Провинциальные Штаты Оверэйссела признали императора своим правителем в январе 1528 года. Однако изгнание гелдерландцев из Утрехта требовало значительных ресурсов, которые могла предоставить лишь Голландия. И она с готовностью сделала это. В течение долгого времени внутренняя торговля через Гелдерланд и Оверэйссел затруднялась войной и беспорядками. Волнения в Утрехте причиняли большие неприятности еще до знаменитого рейда 1528 года, когда военачальник Карела, Мартен ван Россум, прошелся по южной Голландии и разграбил Гаагу. После этого Голландия внесла небывалую сумму, а также было специально собрано 3 500 человек для формирования ядра армии для захвата Утрехта. Эта армия выгнала войска Карела из Утрехта, а затем захватила Хаттем, Элбург и Хардервейк в самом Гелдерланде. В октябре 1528 года Карел капитулировал, признав императора суверенным правителем Утрехта и Оверэйссела, правда, на таких условиях, которые оставили ему полноценный контроль над Гелдерландом, Гронингеном и Дренте.
Провинциальные Штаты Утрехта признали власть Карла V в Горинхеме (Горкуме), на территории Голландии, в тот момент, когда сам император находился в Толедо. Присоединение Утрехта к Габсбургским Нидерландам и принятие провинциальными чиновниками новой присяги на верность прошло под руководством штатгальтера Голландии и Зеландии, Антуана де Лалена, графа Хогстратена (1522–40 гг.). Согласие папы Клемента VII, (Утрехт и Оверэйссел были церковными территориями) было дано с готовностью; Рим был разграблен императорской армией за год до этого, и папа оказался во власти императора.
Авторитет Карла в северных Нидерландах значительно вырос после событий 1528 года. Но именно Голландия предоставила средства, так что теперь возникло напряжение между Провинциальными штатами Голландии и правительством Карла во главе с регентом — сначала Маргаритой, а затем сестрой императора, Марией Венгерской (1531–55 гг.). Регенты и рыцарство (ridderschap) Голландии ожидали соответствующей награды за их поддержку: не только усиления безопасности и улучшения условий торговли, но также и согласия императора на завершение давних споров между новоприсоединенными провинциями и Голландией в пользу последней. Амстердам и западнофризские порты, например, требовали отмены привилегии, запрещавшей голландцам рыбную ловлю вдоль берегов Оверэйссела на Зёйдерзе. В отношении Утрехта Голландия надеялась на некоторую форму присоединения или хотя бы политическое подчинение ей этой провинции. В 1530-х годах Провинциальные Штаты регулярно напоминали брюссельскому правительству, что Голландия сыграла ведущую роль в «редукции» Фрисландии, Утрехта и Оверэйссела и что это должно найти отражение в новой организации правительства этих провинций.
Карл не собирался позволять Утрехту присоединиться к Голландии. Но стратегические соображения и явная невозможность удерживать новые провинции без помощи Голландии повлияли на решение отдать Утрехт в распоряжение того же штатгальтера, что и у Голландии и Зеландии. В 1528 году началось строительство Вреденбурга, крупной цитадели внутри стен Утрехта, на голландские деньги. Это было сделано для того, чтобы держать в страхе местные непокорные цеха. Новый епископ Утрехта, Георг ван Эгмонт (1535–59 гг.), был отпрыском голландского знатного рода. Император, однако, отказался отдать судебную администрацию Утрехта в руки голландско-зеландского Хофа, создав вместо этого в 1528 году отдельный провинциальный высший суд, или Хоф, в Утрехте.
Провинциальные Штаты Голландии использовали свою главную роль в присоединении новых провинций в качестве аргумента в течение 1530-х годов, не только чтобы требовать преимуществ перед этими провинциями, но и чтобы избежать нарастающего давления со стороны Брюсселя. Там хотели, чтобы Голландия вкладывала больше средств в защиту юга Нидерландов от Франции. Штаты Голландии не видели причин, по которым их должна была слишком волновать угроза со стороны Франции в отношении Фландрии и Брабанта. В июне 1536 года голландские Штаты, раздосадованные требованием денег, напомнили Марии, что в течение тридцати лет после смерти Филиппа Габсбургского Голландия сама, без помощи южных провинций, финансировала войны «против» Гелдерланда, Фрисландии и Утрехта и защиту своих кораблей в Балтийском море, параллельно с этим объединяясь с «другими землями» для финансирования защиты от Франции, в чем «они не видели своей пользы, однако же принимали такое участие, как если бы сидели у самого пекла». Голландские Провинциальные Штаты считали, что нужды и приоритеты северных Нидерландов фундаментально отличались от южных, как и было на самом деле.
В начале и середине 1530-х годов внимание императора было сосредоточено на Италии, Средиземном море и борьбе с Францией. В это время Голландию больше всего интересовали отношения с Любеком и Данией-Норвегией и необходимость защиты кораблей и рыболовства в Северном море. В Гелдерланде, Гронингене и Дренте сохранялась нестабильность и интриги против Габсбургов. Герцог Карел располагал несколькими гарнизонами в Оммеландах, но ни один не был расположен в Гронингене. Когда в 1536 году герцог попытался переместить туда войска, чтобы запугать цеха, совет перестал их поддерживать и решил завершить гражданскую войну в провинции путем принятия верховной власти Карла V над городом и его зависимых территорий, Горехтом и Олдамбтом. Штатгальтер Фрисландии, Шенк фон Таутенбург[26], вторгся на эту территорию, нанеся поражение силам Карела и его союзникам веткоперам в битве под Хейлигерле и оккупировав всю провинцию. Кроме того, он завладел пограничной территорией Вестерволде, которую Карл сделал его персональным фьефом и которая с тех пор осталась частью Габсбургских Нидерландов, но не стала частью провинции Гронинген[27]. Вскоре армия Шенка захватила Куворден и установила в Дренте власть Габсбургов. Согласно мирному договору, заключенному в Граве в декабре 1536 года, Карел передал верховную власть над Гронингеном, Оммеландами и Дренте императору.