Численность немецкой полиции в Остланде (кроме Белоруссии) была невелика. В Генеральном округе Литвы немцы сконцентрировали разные полицейские силы: полицию безопасности и службу безопасности (Sicherheitspolizei und Sichersdienst) со штаб-квартирой в Каунасе и отделами (Aussendienstelle Sipo und SD) в Вильнюсе, Шяуляе, Панявежисе, Кретинге и Мариямполе); полиция порядка (Ordnung Polizei), которая состояла из городской полиции (Schutzpolizei) в Каунасе и Вильнюсе и жандармерия (Gendarmerie) в уездах. Численность немецкой полиции в Литве не была постоянной — в разные годы, в зависимости от политической и военной ситуации, она изменялась. Например, высший руководитель СС и полиции имперского комиссариата «Остланд» обергруппенфюрер СС и генерал полиции Фридрих Еккельн (Friedrich Jeckeln) в своём письме от 2 апреля 1943 г. рейхсфюреру СС Гиммлеру утверждал, что «…в Литве имеем только 233 младших офицеров и сотрудников полиции». В Литве также действовали пункты военной разведки и контрразведки (Abwehr), тайная полевая полиция (Geheime Feldpolizei — GFP), которая находилась в распоряжении военной власти[25], железнодорожная полиция и другие учреждения полиции. Вышеперечисленным структурам немецкой полиции соответственно подчинялись подразделения литовской полиции.
Из оперативной команды 3/А (Einsatzkommando 3/А) оперативной группы A (SS-Einsatzgruppe А) были созданы учреждения командира немецкой полиции безопасности и СД в Литве. Из хранящихся в Центральном государственном архиве Литвы (ЦГАЛ) документов трудно понять, почему в период с июля 1941 г. по 24 апреля 1942 г. употреблялось двойное название: «Командир немецкой полиции безопасности и СД в Литве, оперативная команда 3/А». Видимо, этим хотели подчеркнуть двойное подчинение этого органа — формальное генеральному комиссару в Каунасе и фактическое — Главному имперскому управлению безопасности (RSHA) в Берлине. Позже использовалось только одно название — «Командир немецкой полиции безопасности и СД в Литве». Как видно из документов, большинство сотрудников оперативного взвода 3/А перешло служить в учреждения немецкой полиции безопасности и СД в Литве. В отделе немецкой полиции безопасности и СД в Каунасе на 1 декабря 1943 г. было 112 служащих, в Паневежском округе — 6, в Шяуляйском — 7, в городе Вильнюсе — около 40.
Заместитель начальника литовской полиции Тракайского уезда, а затем временно исполняющий обязанности начальника полиции Кретингского уезда Казис Чапликас (Kazys Čaplikas)
26 августа 1941 г. 71 немецкий полицейский был командирован в Литву, служащие из Дрезденского отдела полиции направлялись в Вильнюс, а служащие из Вены-Ноештадт — в Каунас. Руководитель СС и полиции прибыл в Литву ранее и сначала со своим штабом обосновался в Вильнюсе. В состав его штаба вошли представители полиции порядка и полиции безопасности, всего 12 человек. Позже прибыло большее количество полицейских, из них были созданы учреждения немецкой полиции порядка в Литве.
Приступая к исполнению своих обязанностей, генеральный комиссар Литвы д-р Т.-А. фон Рентельн в первой своей речи определил создавшееся правовое положение. Он издал распоряжение, которое ограничило государственную деятельность ВПЛ: запретил праздновать народные праздники, вывешивать национальные флаги[26] и предложил членам правительства принять титулы советников генерального комиссара. ВПЛ не приняло этого предложения. Тогда, 5 августа 1941 г., генеральный комиссар Литвы д-р Т.-А. фон Рентельн официально заявил, что с этого дня, Временное правительство Литвы прекращает свою деятельность. Правительство Германии, руководствуясь условиями военного времени, приказало принять всю гражданскую власть в Литве немецким сотрудникам и представителям гражданской администрации.
Здание Министерства внутренних дел Литовской республики, в котором в начале войны размещался особый отряд СД Вильнюса
Временное правительство Литвы, собравшись 5 августа на последнее заседание в Каунасе, своим решением № 35, в первую очередь упразднило нелюбимое немцами Министерство обороны края и все городские и уездные комендатуры. Подразделения комендатур и охранные штабы с принадлежащими им подразделениями с 5 августа 1941 г. были переданы в распоряжение Министерства внутренних дел. ВПЛ констатировало, что оно было призвано всеобщим восстанием литовцев для воссоздания независимого государства Литвы и честно выполняло свои функции. В течение шести недель существования ВПЛ издало 100 законов, постановлений и распоряжений (закон денационализации городских зданий и земельных участков, закон денационализации предприятий торговли и общественного питания, закон денационализации предприятий промышленности, закон управления земельными участками, изменения закона судебной власти, законы Университета и других учебных заведений и т.д.), восстановлены связи с органами власти в уездах и волостях. Был восстановлен государственный аппарат, отменены все изданные и провозглашенные в советское время законы, жителям Литвы были возвращены все гражданские права и свободы. То есть была воссоздана власть, которая существовала в независимом Литовском государстве. В то же время, не имея для сопротивления физических сил и не соглашаясь сотрудничать с немецкой властью иначе как на равноправных условиях, ВПЛ было вынуждено приостановить свою деятельность против своей воли и воли всего парода. Отказ кабинета министров добровольно передать свои полномочия немецкой администрации и стать её советниками имел и имеет большое политическое значение. Последний запротоколированный текст Временного правительства с меморандумом к органам немецкой власти был нотифицирован и послан бывшему председателю правительства К. Шкирпе. Меморандум ВПЛ (Pro Memoria) от 5 августа 1941 г. о правовом положении Литвы после окончания большевистской оккупации был вручён генеральному комиссару Литвы фон Рентельну с просьбой передать его правительству Германии.
В подготовленном Партией литовских националистов (Lietuvių Nacionalistų partijos — LNP)[27] (руководитель — Зенонас Блинас — Zenonas Blynas) набросках меморандума для правительства Германии говорилось, что немецкая гражданская власть в Литве необязательна, так как Литва не была и не является частью Советского Союза. «Литовский народ ждёт, что в ближайшем будущем Великая Германия признает его и позволит восстановить и реализовать суверенитет страны хотя бы в южных и восточных границах по договору Литвы и России 1940 года и в установившихся западных границах, вместе с тем создавая возможность восстановить хозяйственную мощь, предназначенную для оказания содействия войне Великой Германии и её окончанию».
