18 ноября 1991 года город был взят сербами. По подсчетам, несколько сотен солдат и мирных жителей были уничтожены сербскими войсками и около 20 000 жителей были изгнаны. Всего во время боя погибло около 3000 человек. Вуковар претерпел этнические чистки от несербского населения и стал частью самопровозглашенной Республики Сербская Краина. Длительная оборона Вуковара, невзирая на его захват, имела решающее значение для дальнейшего исхода войны, она не позволила осуществить планы югославского правительства по немедленному захвату Хорватии. Город оставался в руках сербов до 1998 года. После подписания Эрдутского соглашения его возвратили в состав Хорватии. В селе Эрдут 12 ноября 1995 года между властями Республики Хорватии и местными сербскми властями Восточной Славонии, Бараньи и Западного Срема было заключено соглашение о мирном урегулировании хорватской войны за независимость в восточной части Хорватии.
Изрядно поврежденную в боях Вуковарскую водонапорную башню сохранили как символ конфликта. Каждый год 18 ноября на памятном мероприятии присутствуют первые официальные лица и действующий президент страны. Город считается местом хорватского патриотизма. В День памяти в 2018 году министр обороны Дамир Крстичевич произнес следующие слова: «Вуковар значил всё для Хорватии в годы войны, а сегодня он символ геройства и отпора в Отечественной войне. Мысленно мы с погибшими и пропавшими без вести хорватскими защитниками, которые пожертвовали собой ради мира и свободы Хорватии». Любовь к своей Родине добавляла мужества и смелости хорватским воинам, а вуковарцы сражались и защищали свои дома, свою семью, своих детей – самое дорогое на свете.
Вуковарская водонапорная башня
Деятели культуры и искусства тоже не оставались в стороне в такие сложные времена. В 1994 году, во время войны за независимость, режиссер Боро Драшкович снял художественный фильм «Вуковар», который стал культовым. Ему удалось передать драматичность событий и испытания сербскохорватской супружеской пары, которая в одно мгновение стала заложницей военных действий в бывшей Югославии. Драшкович, будучи сербом по национальности, отобразил равные страдания жителей города вне зависимости от национальности. В 2010 году бывший сербский президент Борис Тадич принес официальные извинения хорватской стороне за преступления, совершенные в годы войны. На тот момент событие стало большим шагом в урегулировании двусторонних отношений. Вопросами о том, кто был жертвой, кто пострадал больше, по-прежнему задаются и хорваты, и сербы. Важно, что некоторые хорватские политики тоже признали ответственность Хорватии и высокопоставленных лиц за развязывание конфликта.
В октябре 1991 года Совет Безопасности ООН ввел ряд экономических санкций против Югославии. Сербское руководство решило отказаться от плана захвата всей Югославии, кроме уже ушедшей Словении. Новая идея состояла в том, что Югославия будет уменьшена и в ее состав войдут: Сербия, Черногория, Босния и Герцеговина, Македония и области Хорватии, которые захватили местные сербы. Также имелся вариант объединения без Македонии и Боснии, но при условии сохранения за Белградом сербских районов. 19 декабря 1991 года в Книне была провозглашена Сербская Республика Краина.
В 1991 году резко обострилась ситуация в Боснии и Герцеговине. 15 октября 1991 года боснийский парламент провозгласил суверенитет. 23 декабря 1991 года Хорватия, Словения, Македония, Босния и Герцеговина обратились в Европейский союз с просьбой о дипломатическом признании их независимости. 7 января 1992 года Милошевич и Туджман договорились о прекращении огня. Сайрус Вэнс, уполномоченный ООН, представил план о размещении «голубых касок» ООН в Хорватии в качестве наблюдателей за соблюдением мира. Белград и Загреб приняли план. На этом первый этап войны закончился. В январе 1992 года подавляющее большинство европейских государств и ряд неевропейских стран признали суверенитет и независимость Словении и Хорватии. Соответственно, в январе 1992 года СФРЮ прекратила свое существование. Но, как покажет время, трагические события еще не закончились.
Весной 1992 года войска ООН разместились на границах Хорватии. Сербы мечтали о расширении территории Краины, а Милошевич планировал присоединение Сербией Краины. С 1992 года началась война в Боснии, и угроза вторжения в Хорватию отступила. В 1992 году ЮНА была вынуждена покинуть Южную Далмацию. Сербские войска встретили ожесточенное сопротивление от мусульман. В 1994 году был заключен договор о мусульмано-хорватской федерации в Боснии и Герцеговине и о возможном объединении Боснии и Герцеговины с Хорватией. 1992–1994 годы прошли в основном в непродуктивных переговорах между Сербией и Хорватией. В это время хорваты наращивают военные ресурсы и усиленно готовятся к продолжению войны.
За время войны было проведено множество военных операций с обеих противоборствующих сторон под кодовыми названиями: Vrbas ‘92, «Коридор», «Масленица», «Неретва-93», Medak Pocket, «Зима-94», «Лето-95» и др. Каждая операция имела большое значение, но самыми решающими в окончании войны будут «Шторм», «Молния» и «Буря». 1 мая началась операция «Молния», в ходе которой хорватские войска заняли Западную Славонию. 4 августа 1995 года прошла операция «Шторм»: сто пятьдесят тысяч хорватских солдат начали наступление на трехсотмильном фронте в Краину.
Американо-хорватские военные консультации в Пентагоне. Хорватский генерал Крешимир Чосич и американский генерал Уэсли Кларк. 1991
9 августа 1995 года проведенная хорватами операция «Буря» завершилась капитуляцией войск Краины у Войнича. Это было последнее мощное сражение хорватской войны за независимость и решающим фактором в исходе войны в Боснии. Хорватская армия за несколько дней полностью разгромила основную часть вооруженных сил Сербской Краины и воссоединила Книн и сопредельные территории в состав страны. Военная операция спровоцировала массовую эвакуацию сербов с этих земель. 21 ноября 1995 года Туджман подписал Дейтонское соглашение о прекращении огня, разделении враждующих сторон и обособлении территорий, положившее конец боснийской войне. Президенту Туджману после успешно проведенной операции и победы присвоили звание маршала. В 1998 году оставшаяся часть Краины в Восточной Славонии, Баранье и Западном Среме мирно вернулись в состав Хорватии. Границы Хорватии были полностью восстановлены в том виде, в каком они существовали в СФРЮ.
Представители культуры, поэты и писатели всегда следили за судьбой своей страны и за текущей ситуацией в мире. Они писали стихи и произведения не только о любви, о красоте своей Родины, но и выражали свое отношение к происходящим трагическим событиям. Так, у поэта Петара Гуделя вышел в свет ряд стихотворений, которые очень точно передают боль и волнение за судьбу людей. В 2004 году он напишет (перевод Жанны Перковской):
