Ситуация не изменилась с появлением корабельных батальонов, солдаты которых, будучи в составе десантно-абордажных команд, находились под началом и командира корабля, и командира своего батальона, как правило, являвшегося начальником морской пехоты эскадры и входившего в состав военного совета.
Несколько иначе, в силу его специфики, дело обстояло с адмиралтейским батальоном, чьей основной службой было несение караулов в портах и базах флота. При этом он подчинялся, кроме своего командира, и руководству этих объектов. Тем не менее реалии были таковы, что чины галерного батальона могли привлекаться к выполнению самых разнообразных задач. Например, в Петербурге некоторые его подразделения находились у «городового строения», осуществляя контроль хода работ, подвоза необходимых материалов, состояния команд «работных людей». Кроме того, они привлекались, наряду со служащими других сухопутных полков, к выполнению полицейских и таможенных функций, в частности к поимке дезертиров и бежавших «работных людей», борьбе с «разбойными ватагами», тушению пожаров, приему товаров, привозимых в столицу водным путем. Во многом это объяснялось и тем, что едва ли не все сферы жизни Петербурга этого времени находились в ведении А.Д. Меншикова, известного государственного и военного деятеля, ближайшего сподвижника Петра. Помимо прочего он был генерал-губернатором Санкт-Петербурга, в жизни которого военный люд играл заметную роль, и солдаты и офицеры адмиралтейского батальона не являлись исключением. Меншиков, осуществляя свои губернаторские функции, нередко использовал служащих нескольких полков пехоты и кавалерии для выполнения различных поручений, и подразделения адмиралтейского батальона, находясь постоянно на берегу, в той или иной степени также оказывались востребованными для нужд хозяина строящегося невского «парадиза». В связи с этим не без участия Меншикова к подразделениям адмиралтейского батальона, находившимся в Петербурге и Кронштадте, время от времени присоединялись солдатские команды, в том числе и состоящие большей частью из рекрутов. Некоторые из них оставались в батальоне, пребывание там других было непродолжительным: в 1716 г. часть этих команд составила отдельный солдатский батальон, приписанный к адмиралтейскому ведомству.
Александр Меншиков. Гравюра Ж. Симона. 1697 г.
С другой стороны, те или иные части морской пехоты могли быть временно расформированы; так, например, в 1712 г. офицеры адмиралтейского батальона Савенкова были признаны «весьма негодными к делу» и отправлены в гарнизоны, в то время как нижние чины были определены в матросы. Чуть позже, в 1715 г., галерный батальон (659 чел.) был раскассирован в матросы и пушкари. Подобного рода трансформации случались нередко, поскольку в условиях войны официальная регламентация отходила на второй план, а во главу утла ставились требования момента, соображения военной целесообразности и прагматизма. Тем более что в случае необходимости корабельные экипажи, многие из которых имели соответствующий опыт, принимали участие, и не без успеха, в высадках десанта и абордажах. И если нижние чины морских батальонов периодически пополняли ряды судовых команд, то и матросы направлялись в эти батальоны (нередко за различные провинности, в виде наказания), и их строевая и боевая подготовка была в целом не намного ниже, чем у морских солдат. Что же касается гребного флота, то там совмещение функций солдата и гребца было делом обычным, ведь галеры или скампавеи использовались в основном для доставки морских десантов.
С вступлением Северной войны в завершающую стадию значение последних все более возрастало. Из пехотных полков к 1719 г. на флот было определено 2707 чел., но с течением времени это число менялось, поскольку в рейдах на шведские берега участвовали как крупные пехотные соединения, доставлявшиеся к месту высадки на гребных эскадрах, так и небольшие группы, которые перевозились на нескольких галерах или шмаках. Помимо солдат, принимавших участие преимущественно в боевых действиях, на кораблях имелись и так называемые караульные солдаты, которые несли сторожевую службу при нахождении в портах или во время десантных операций, когда корабельные солдаты и часть экипажа высаживались на берег, выполняли конвойные функции при арестантах, следили за доставкой на борт корабельных «припасов». В караульные солдаты в основном зачислялись солдаты морских батальонов, пехотных полков, а также члены корабельных экипажей. Караульные солдаты могли быть задействованы в составе десанта, и, как правило, они состояли в абордажных командах. В свою очередь, солдаты морских батальонов, находясь на борту, регулярно привлекались к несению караульной службы.
Согласно штатам Балтийского флота, в 1720 г. на трехпалубных кораблях (90 пушек) численность корабельных солдат определялась в 206 чел., караульных — в 26, на кораблях с 80 пушками предписывалось находиться 161 корабельному и 24 караульным солдатам.
На двухпалубных кораблях солдатские команды состояли: на 76-пушечных (1 ранга) из 121–136 корабельных и 20 караульных, на 60-пушечных (2 ранга) из 114 корабельных и 18 караульных, на 50-пушечных (2 ранга) из 80 корабельных и 16 караульных солдат. На 14-пушечных кораблях численность тех и других соответствовала 9 и 8 чел. Всего по кораблям в 1720 г. было расписано 3705 корабельных и 675 караульных солдат.
В ходе войны в десантах и абордажах наряду с морским полком и батальонами участвовали гвардейские и армейские части, которые могли включаться в более крупные соединения. В частности, в 1712–1713 гг. в Финляндии оперировал десантный корпус в составе 18 пехотных полков и отдельных батальонов, соединенный с галерным флотом.
В 1720 г. в связи с его активными действиями в шведских шхерах возникла необходимость в создании более крупного, чем галерный батальон, подразделения. Посредством отбора из 21 пехотного полка по 1 капральству был сформирован галерный полк, о котором И. Боцис говорил еще в 1710 г. Его учреждение объяснялось также и тем, что в галерном флоте около 40 % солдат являлись одновременно и гребцами.
При морских переходах и последующем десантировании и вооруженном контакте они не выглядели особенно свежими и нередко нуждались в сторонней поддержке. Значительное увеличение л/с галерных солдатских команд затруднялось, помимо естественного в ходе войны дефицита людей, ограниченной вместимостью гребных судов. Образование галерного полка в период интенсивных рейдов к шведским берегам на время и отчасти должно было укрепить десантную мощь гребного флота. Этому также способствовало и то, что солдатские команды, входившие в его состав, в 1721 г. были организованы в три роты (334 чел.); они являли собой самостоятельные подразделения, которые могли действовать независимо, с учетом конкретной обстановки.
Тем не менее выбранный ранее Петром I курс на активное привлечение к строевой, сухопутной службе матросов оставался по-прежнему актуальным. Примеры, когда корабельные экипажи с успехом действовали в десанте и при абордажах, были не единичны. Не случайно Петр уделял особое внимание обучению матросов «пальбе» из ружей и экзерцициям по пехотным уставам. Обучение шло не только на берегу, но и в походах.