Во время захвата заложников чеченскими боевиками в театральном центре на Дубровке в Москве 23–26 октября 2002 г. Патрушев входил в штаб по освобождению захваченных террористами людей. Увы, операция обернулась большими жертвами. Тогда вместе с террористами на Дубровке от отравления газом погибли и 129 заложников. Причем многих из них можно было спасти – не хватило квалифицированных врачей и машин скорой помощи. Патрушев к тому же запутался в цифрах – сначала утверждал, что уничтожены 34 боевика, потом – что «41 боевик во главе с Мовсаром Бараевым»[8]. Многие СМИ предсказывали в те дни скорую отставку Н. Патрушева в связи с тем, что возглавляемая им ФСБ проглядела несколько десятков вооруженных бандитов, проникших в Москву, однако отставки не последовало. Мало того, 3 марта 2003 «Новая газета» сообщила, что Н. Патрушеву закрытым указом президента было присвоено звание Героя России за успехи в чеченской войне[9].
Террористы, тем не менее, продолжали наносить по России удар за ударом.14 мая 2003 г. на религиозном празднике в селе Илисхан-Юрт три женщины-смертницы взорвали пояса шахидов, в результате чего погибли 26 и были ранены 150 человек. 5 июня в Моздоке (Северная Осетия) женщина-смертница взорвала пояс шахида в автобусе, погибли 19 человек, ранены 12. 5 июля 2003 г. в Москве в Тушино подорвались две смертницы, 16 убитых, 40 раненых. 10 июля не удалась попытка взорвать кафе в Москве на Тверской, смертница арестована, при разминировании бомбы погиб сапер ФСБ. 1 августа 2003 г. в Моздоке террорист-смертник взорвал военный госпиталь, по официальным данным погибло 50 человек, 80 ранены (есть основания подозревать, что число пострадавших было занижено). 3 сентября 2003 г. террористы взорвали электричку Минеральные Воды – Кисловодск, пятеро погибших, более 50 раненых. 5 декабря 2003 г., накануне парламентских выборов, вновь была взорвана электричка Минеральные Воды – Кисловодск, 44 погибших, десятки раненных. 8 декабря, на следующий день после выборов, террористка-смертница, направлявшаяся с поясом шахида в Государственную Думу, взорвалась у гостиницы «Националь» (шестеро погибших, раненые). 6 февраля 2004 г. в час пик был взорван вагон в московском метро, погибло около 40 человек, более 100 – тяжело ранены. В конце августа 2004 г. в России было совершено несколько терактов: взрыв автобусной остановки на Каширском шоссе в Москве, взрывы двух пассажирских самолетов, взрыв у метро «Рижская».
1 сентября 2004 г. группа террористов захватила школу в североосетинском городе Беслане, взяв в заложники около 1000 человек, в том числе множество детей. 3 сентября 2004 г., во время операции по освобождению заложников, погибло более 300 человек, среди них более 100 детей.
Вместе с ростом числа жертв терактов росло и число обезвреженных террористов в докладах Патрушева. 5 октября 2004 г. он заявил в интервью НТВ, что в 2004 году российские спецслужбы предотвратили в общей сложности более 500 терактов. По его словам, около 200 из них «имели бы серьезный резонанс в обществе». 12 мая 2005 г., выступая в Госдуме, сказал, что ФСБ арестовала организаторов и исполнителей террористических актов в метро, у станции «Рижская», в электропоездах в Минеральных Водах, на остановках общественного транспорта в Воронеже и Краснодаре. Утром 10 июля доложил президенту В. Путину о ликвидации Шамиля Басаева (который, согласно альтернативной версии, подорвался сам вместе с КАМАЗом, на котором вез взрывчатку к месту теракта в Назрани). 20 июля Патрушев получил за это орден «За заслуги перед Отечеством» I степени. Он отрапортовал при этом: «Та война, которая была нам объявлена не только террористами, лидерами бандформирований, но и теми, кто поддерживал, финансировал, давал возможность лечиться (боевикам), она нами практически выиграна». Всего через два года, 29 марта 2010 г., в московском метро произошло два взрыва. Погибло более 40 человек. Меньше чем через год последовал взрыв в аэропорту Домодедово. Погибло еще 40 человек и более 130 были ранены.
Быть может, Патрушев бы и поставил новый рекорд бессменного пребывания на посту директора ФСБ, если бы не один его скандальный прокол. 8 апреля 2008 г. на заседании Национального антитеррористического комитета (НАК) Патрушев сообщил, что «бандиты и их сообщники в Южном федеральном округе прилагают усилия по идеологической обработке молодежи и пополнению своих рядов» и при этом пользуются поддержкой не только «эмиссаров зарубежных террористических и религиозно-экстремистских организаций». Информационную поддержку террористам «в немалой степени оказывают отдельные иностранные неправительственные организации»[10], заявил шеф ФСБ. Его выступление многие восприняли как попытку дискредитировать иностранные НКО, работающие в России. Так, российский представитель Human Rights Watch Александр Петров потребовал от главы ФСБ доказательств причастности НКО к террористическим действиям. А директор российского отделения Всемирного фонда дикой природы назвал речь Патрушева «безответственной»[11]. Скандал этот случился уже при новом президенте, и 12 мая 2008 г. Дмитрий Медведев назначил Патрушева секретарем Совета безопасности, освободив его от должности директора ФСБ.
Конечно, не только этот прокол заставил Медведева, скорее всего, по наводке Путина, убрать Патрушева со столь ответственного поста. Дело в том, что его многочисленные провалы никак не влияли на его стремление, совсем неподходящее директору спецслужбы, купаться в лучах славы. В августе 2003 г. в ходе учений ФСБ по «локализации террористических проявлений в условиях плоскогорья» Н. Патрушев неожиданно совершил в составе группы спецназа подъем на вершину Эльбруса на высоту 5642 метра, что и показали по всем телеканалам. 7 января 2007 года вместе с Артуром Чилингаровым и своим братом он посетил Антарктиду и Южный полюс на вертолетах. Это тоже прогремело во всех теленовостях. Потом президент Путин наградил его брата В. Патрушева Орденом Дружбы за эту экзотическую экспедицию. С ней были связаны и другие скандалы. Раздражало Кремль и широко рекламируемое увлечение Патрушева волейбольным спортом.
23 октября 2009 г. президент Медведев заявил, что дал поручение заменить в течение месяца возглавляющих российские спортивные федерации чиновников на «профессионалов, уделяющих своему виду спорта 24 часа в сутки»: «Необходимо работать, – сказал он, – хватит штаны просиживать, проводить все время в командировках за границей. Чиновники пусть возглавляют попечительские советы федераций». Патрушев на этот момент уже был секретарем Совбеза, но все еще возглавлял Всероссийскую федерацию волейбола. В ноябре 2009 г. он ушел и с этого с поста.
В начале 2009 г. в России началась очередная шумно-показательная кампания по борьбе с коррупцией, в рамках которой высшие чиновники стали публиковать сведения о доходах за 2008 г. Патрушев сообщил, что его общий доход составил 3,3 млн руб. В апреле 2010 г. по отчету за 2009 год у него в том, что касается недвижимости и автомобилей, все осталось по-прежнему – одна квартира площадью 265 кв. м, дача в аренде площадью 265 кв. м, два машино-места по 18 кв. м и ни одного автомобиля. У супруги секретаря СБ, правда, к земельному участку прибавилась квартира в пользовании площадью 239,9 кв. м. Но вот его денежные доходы за год неожиданно и существенно выросли с 3,3 до 13,5 млн руб. Может быть, в СБ платили больше, чем в ФСБ, или сыновья помогли. Патрушев, кстати, успел обеспечить им теплые места. Младший сын Андрей в июле 2003 года окончил Академию ФСБ России, работал в ФСБ в так называемом промышленном отделе, а в сентябре 2006 г. назначен советником директора Роснефти Игоря Сечина. Старший сын Дмитрий работал вице-президентом банка ВТБ, а в мае 2010 года в возрасте 32 лет был назначен на пост председателя правления Россельхозбанка, 4-го по величине банка России. (Данные о Патрушеве приведены по публикациям на сайтах compromat.ru; anticompromat.org;compromat.ru; chekist,ru; Wikipedia. org).