1926 году вышел первый том первого издания БСЭ. В его редакционной статье говорилось: «Предпринято дело громадной важности и исключительной трудности. Оно служит большой культурно-политической задаче… Быть памятником нашей великой революционной эпохи и опорой для дальнейшего массового социалистического строительства, основанного на новейших научных данных, - вот чем должна стать Энциклопедия». И она выполнила эти задачи. С тех пор вышло три издания БСЭ, три издания Малой советской энциклопедии, кроме того, издаются и отраслевые энциклопедии, но колыбелью БСЭ была Волхонка, 14.
1925 год вообще оказался знаменательным в истории дома: он передавался Коммунистической (с момента организации в 1918 г. до 1924 г. - Социалистическая) академии. В этом году туда переехал из особняка на Знаменке, 11 (угол нынешних улиц Фрунзе и Маркса и Энгельса), только ее аппарат, а через полтора года - и некоторые входящие в академию институты, секции, состоящие при ней общества, редакции журналов и ее издательство. Председателем президиума стал известный историк М. Н, Покровский.
Поскольку после победы Великой Октябрьской социалистической революции центр международного рабочего и коммунистического движения переместился в Советскую Россию, возникла необходимость в дальнейшей планомерной и последовательной разработке вопросов теории научного социализма и коммунизма. Выполнить эту важнейшую задачу, а также осуществлять борьбу с буржуазными и мелкобуржуазными извращениями марксизма, за строгое проведение принципов диалектического материализма как в общественных, так и в естественных науках и разоблачение идеализма призвана была Коммунистическая академия. Помимо этого, академия должна была в короткий срок воспитать кадры ответственных работников, теоретически подготовленных к выполнению задач социалистического строительства.
Это было совершенно новое научно-исследовательское учреждение, которое охватывало и учебно-просветительные задачи (при академии были открыты курсы марксизма-ленинизма; они потом выделились в самостоятельную организацию), и объединяло всю научно-исследовательскую работу, проводившуюся разрозненно в разных институтах и комиссариатах. «Академия… должна сделаться своего рода Госпланом в области идеологии… организованно поставить на службу советской практики научную марксистскую мысль», - говорилось в редакционной статье «Вестника Социалистической академии» (1922, № 1). Академия привлекла к работе и европейских марксистов, чтобы стимулировать развитие марксистской мысли за рубежом. В состав действительных членов академии были избраны в 1918 году В. Д. Бонч-Бруевич, А. В. Луначарский, М. Н. Покровский, И. И. Скворцов-Степанов, Н. К. Крупская и другие. Позже число членов академии было расширено, в нее вошли О. Ю. Шмидт, П. И. Стучка, А. М. Коллонтай, Г. М. Кржижановский, А. М. Горький, К. А. Тимирязев и другие видные ученые и выдающиеся общественные деятели.
Сначала академия занимала здание бывшей Практической академии коммерческих наук (Покровский бульв., 5), а затем в 1921 году она переезжает на Знаменку, И; оттуда, как уже говорилось, на Волхонку, 14.
Вскоре после переезда академии на Волхонку стали ощущаться теснота и неудобство старого барского особняка. Именно тогда и встал вопрос о надстройке дома. «Управление делами в отчетном 1928/29 году, - читаем мы в кратком отчете о работе Коммунистической академии за 1928 - 1929 гг., - выполнило большую работу, связанную с надстройкой двух этажей над домом по Волхонке, 14… По надстройке 2-х этажей в 1928/29 г. истрачено 572.609 руб. Строительные работы были начаты в июле 1927 года». Несмотря на то что проживший почти два века нетронутым дом потерял свой первоначальный вид (утратил, в частности, фронтон), авторы проекта надстройки отнеслись с уважением к его архитектуре, не нарушив грубо основных пропорций старой части здания.
Теперь Коммунистическая академия разместилась удобно, а выросшая к тому времени библиотека, которая находилась еще в старом здании, на улице Фрунзе, оказалась в крайне стесненном положении: многие книги просто не выдавались из-за того, что невозможно было подступиться к стеллажам. В 1926 году академия возбудила по докладу библиотеки ходатайство об ассигновании ей средств для постройки специального библиотечного здания.
Было составлено несколько проектов, из них приняли проект С. Е. Чернышева. Снесли все старые строения, составлявшие часть бывшей усадьбы С. М. Голицына, кроме, разумеется, главного дома и двух флигелей, и жильцов переселили. Но библиотечное здание так и не было построено.
Структура Коммунистической академии несколько раз менялась, и к 1928 - 1930 годам вместо прежних секций были созданы институты истории, философии, экономики, а также литературы, искусства и языка и несколько научных обществ. В эти годы на Волхонке в главном доме помещались: президиум Коммунистической академии, ее хозяйственный и финансовый отделы, институты: аграрный, философии, истории, мирового хозяйства и мировой политики (директором был известный ученый академик Е. С. Варга), Институт по изучению высшей нервной деятельности (Институт мозга), которым с момента основания в 1918 году руководил В. М. Бехтерев. Но в здании на Волхонке он проработал очень недолго - 28 декабря 1927 года скончался. В некрологе А. В. Луначарский писал: «Он меня поразил прежде всего своей степенной красотой… К Советской власти Бехтерев сразу отнесся с той же степенностью и спокойствием… Бехтерев был прозорливым и, приехавши ко мне, с первых же слов сказал: «Считая, что Россия надолго, а может быть, и навсегда получает новый облик, хочу в этой новой России обеспечить продолжение развития той области, которой я отдал свою жизнь». Область, которой Бехтерев отдал свою жизнь, - это как раз работа над мозгом».
Здесь же, на Волхонке, находились секции: естественных и точных наук, кооперативная, теории и практики международного женского движения, по изучению проблем войны, экономическая. С секциями соседствовали общества: историков-марксистов, врачей-материалистов; в здании Коммунистической академии проходили заседания Общества статистиков-марксистов и Общества биологов-материалистов, состоящих также при академии. Наконец, на Волхонке, 14, находились издательство Комакадемии, редакции журналов «Историк-марксист», «Вестник Коммунистической академии» (в редколлегии М. Н. Покровский, О. Ю. Шмидт и др.), «На аграрном фронте», «Мировое хозяйство и мировая политика». В левом флигеле было общежитие аспирантов академии.
В 1936 году Коммунистическая академия была упразднена. К этому времени активизировалась и получила широкое развитие работа Академии наук СССР и параллельное существование двух академий (Комакадемия включала 21 институт) было признано нецелесообразным. Институты Коммунистической академии перевели в систему Академии наук. Часть из них осталась в доме № 14 на Волхонке. Так, с 1936 по 1960 год здесь работал созданный на основе Института истории Коммунистической академии и Историко-архео-графического института АН СССР Институт истории АН СССР. За эти годы его деятельность связана с именами таких выдающихся ученых, как Е. В. Тарле, Б. Д. Греков, С. Б. Веселовский, В. П. Волгин, Ю. В. Готье, Е. А. Космин-ский, Н. М. Лукин, А. М. Панкратова, С. Д. Сказкин, М. Н. Тихомиров, В. М. Хвостов, С. В. Бахрушин, С. К. Богоявленский.
С 1937 по 1953 год бессменным директором